与各种屠戮手段相结合的,就是朱棣在即位初期大行“告密风”,即鼓励民间揭发“建文余党”,有揭发者一律重赏。比如淮安一个叫丁玉的渔民,就借着乡邻祭祀的机会,诬告乡亲们结社谋反,导致数十乡亲被杀,他自己反而官升御史。到永乐二年(1404),全国闹得告密成风。是年二月,御史李至刚劝朱棣说:而今民间那些争着揭发“建文余党”的,无外乎是三种人,一种是家境贫寒,想靠告密来免赋税的;一种是奸诈小人,求升官发财的;还有一种,就是受朝中官员指使,收钱陷害他人的。朱棣随即下诏书,声明“告密”必须有真凭实据,查出有诬陷三四个人的,要处三年以下徒刑;诬陷十个人以下的,处十年以下徒刑;诬陷十个人以上的,凌迟处死。
尽管鼓励告密的朱棣,采取了种种补救,来防止告密中的诬陷情形,但永乐一朝的告密之风,依然持续近十年。它的戛然而止,是因为永乐九年(1412)的一次“意外事件”。是年科举,“建文余党”练子宁(被朱棣“瓜蔓抄”杀害)的儿女亲家钱习礼考中进士,因成绩优异被朱棣选为“庶吉士”,却很快遭人告密,挖出了他这桩“老底”。但得知真相的朱棣,非但没有处罚钱习礼,反而不以为然地说:“就算是练子宁本人活到今天,我依然会重用他,何况是他的儿女亲家?”自此之后,告密之风渐息。
严酷清算“建文余党”的朱棣,登基后当然也没忘记帮他打天下的功臣们,他除了大封“靖难五公爵”等功臣外,连帮助过他的普通百姓士兵也没有忘记。河北地区凡是曾奋勇“支前”的妇女,每人赏赐彩帛二表里,银钞百锭,相当于人民币五万多块。最幸运的,当属一位叫周小二的上海船工,朱棣渡江进南京的船,是由他撑船摆渡的,事后他家不但被免除赋税三年,他本人更官封“巡检使”,摇身一变成了“朝廷命官”。此人也因此成为中国历史上“最幸运船工”。